Η Διοίκηση των Νοσοκομείων έλαβε όλα τα απαραίτητα μέτρα για την εύρυθμη λειτουργία και των δυο Νοσοκομείων, χωρίς προβλήματα, κατά τη διάρκεια των έντονων καιρικών φαινομένων. Το μοναδικό πρόβλημα που δημιουργήθηκε ήταν η εισροή υδάτων μόνο στο διάδρομο των Χειρουργείων του Γ.Ν «ΒΕΝΙΖΕΛΕΙΟ».
Άμεσα ο χώρος απομονώθηκε και πάρθηκαν όλα τα απαιτούμενα μέτρα προκειμένου να συνεχιστεί η ασφαλής λειτουργία των Χειρουργείων, ως προς την αντιμικροβιολογική τους θωράκιση.
Για λόγους ασφαλείας τη Δευτέρα 09/01/2017 αναβλήθηκαν όλα τα τακτικά Χειρουργεία και πραγματοποιήθηκαν μόνο τα έκτακτα, ενώ ήταν σε ετοιμότητα λειτουργίας τα Χειρουργεία του Πανεπιστημιακού Νοσοκομείου Ηρακλείου. Την Τρίτη 10/01/2017 είχε αποκατασταθεί η πλήρης λειτουργία των Χειρουργείων.
Η Διοίκηση σε συνεργασία με την Τεχνική Υπηρεσία, κάνει όλες τις απαραίτητες ενέργειες προκειμένου σε σύντομο χρονικό διάστημα να μην επαναληφθούν τέτοιου είδους φαινόμενα. Επίσης η Κατασκευάστρια Εταιρεία, η οποία αποπεράτωσε την κατασκευή των Χειρουργείων το 2008 (οριστική παραλαβή το 2010), κλήθηκε για έλεγχο τυχόν κατασκευαστικών αστοχιών.